Key info


Date:
8 May 2020

Authors:
Thomas A Mellan, Henrique H Hoeltgebaum, Swapnil Mishra, Charlie Whittaker, Ricardo P  Schnekenberg, Axel Gandy, H Juliette T Unwin, Michaela A C Vollmer, Helen Coupland, Iwona Hawryluk, Nuno Rodrigues Faria, Juan Vesga, Harrison Zhu, Michael Hutchinson, Oliver Ratmann, Melodie Monod, Kylie Ainslie, Marc Baguelin, Sangeeta Bhatia, Adhiratha Boonyasiri, Nicholas Brazeau, Giovanni Charles, Laura V Cooper, Zulma Cucunuba, Gina Cuomo-Dannenburg, Amy Dighe, Bimandra Djaafara, Jeff Eaton, Sabine L van Elsland, Richard FitzJohn, Keith Fraser, Katy Gaythorpe, Will Green, Sarah Hayes, Natsuko Imai, Ben Jeffrey, Edward Knock, Daniel Laydon, John Lees, Tara Mangal, Andria Mousa, Gemma Nedjati-Gilani, Pierre Nouvellet, Daniela Olivera, Kris V Parag, Michael Pickles, Hayley A Thompson, Robert Verity, Caro- line Walters, Haowei Wang, Yuanrong Wang, Oliver J Watson, Lilith Whittles, Xiaoyue Xi, Lucy Okell, Ilaria Dorigatti, Patrick Walker, Azra Ghani, Steven Riley, Neil M Ferguson1, Christl A. Donnelly, Seth Flaxman and Samir Bhatt1

1Correspondence:
neil.ferguson@imperial.ac.uk
s.bhatt@imperial.ac.uk
t.mellan@imperial.ac.uk

Download the full PDF for Report 21 (English) See all reports

WHO Collaborating Centre for Infectious Disease Modelling, MRC Centre for Global Infectious Disease Analysis, Abdul Latif Jameel Institute for Disease and Emergency Analytics, Department of Mathemtics, Imperial College London, Department of Statistics, Nuffield Department of Clinical Neurosciences, University of Oxford

Summary

Brazil is an epicentre for COVID-19 in Latin America. In this report we describe the Brazilian epidemic using three epidemiological measures: the number of infections, the number of deaths and the reproduction number. Our modelling framework requires sufficient death data to estimate trends, and we therefore limit our analysis to 16 states that have experienced a total of more than fifty deaths. The distribution of deaths among states is highly heterogeneous, with 5 states—São Paulo, Rio de Janeiro, Ceará, Pernambuco and Amazonas—accounting for 81% of deaths reported to date. In these states, we estimate that the percentage of people that have been infected with SARS-CoV-2 ranges from 3.3% (95% CI: 2.8%-3.7%) in São Paulo to 10.6% (95% CI: 8.8%-12.1%) in Amazonas. The reproduction number (a measure of transmission intensity) at the start of the epidemic meant that an infected individual would infect three or four others on average. Following non-pharmaceutical interventions such as school closures and decreases in population mobility, we show that the reproduction number has dropped substantially in each state. However, for all 16 states we study, we estimate with high confidence that the reproduction number remains above 1. A reproduction number above 1 means that the epidemic is not yet controlled and will continue to grow. These trends are in stark contrast to other major COVID-19 epidemics in Europe and Asia where enforced lockdowns have successfully driven the reproduction number below 1. While the Brazilian epidemic is still relatively nascent on a national scale, our results suggest that further action is needed to limit spread and prevent health system overload.

Translations

Português - Portuguese

8 May 2020 - Imperial College London

Report 21 - Estimating COVID-19 ca ses an d reproduction number in Brazil

Summary
O Brasil é atualmente o epicentro da COVID-19 na América Latina. Neste relatório descrevemos a epidemia brasileira usando três medidas epidemiológicas: número de infecções, número de óbitos e número de reprodução. Nossa modelagem requer um número mínimo de óbitos para que tendências possam ser estimadas, portanto limitamos nossa análise aos 16 estados com mais de cinquenta óbitos reportados. A distribuição de óbitos entre os estados é altamente heterogênea, com cinco estados ---  São Paulo, Rio de Janeiro, Ceará, Pernambuco e Amazonas --- contabilizando 81% dos óbitos reportados até o momento. Nestes estados, estimamos que a porcentagem de pessoas infectadas por SARS-CoV-2 varia de 3,3% (IC95%: 2,8%-3,7%) em São Paulo a 10,6% (IC95%: 8,8%-12,1%) no Amazonas. No início da epidemia, o número de reprodução (uma medida de intensidade de transmissão) indicava que um indivíduo infectado infectava em média três a quatro outras pessoas. Após a implementação de intervenções não-farmacológicas como fechamento de escolas e redução da mobilidade da população, mostramos que o número de reprodução caiu substancialmente nos estados. No entanto, nos 16 estados analisados, estimamos com alto grau de confiança que o número efetivo de reprodução mantém-se superior a 1. O número de reprodução acima de 1 significa que a epidemia ainda não está sob controle e continuará a crescer. Essa tendência contrasta com outros importantes focos da epidemia de COVID-19 na Europa e Ásia, onde lockdowns obtiveram sucesso em reduzir o número reprodutivo para abaixo de 1. Embora em escala nacional a epidemia brasileira ainda seja relativamente inicial, nossos resultados sugerem que mais ações são necessárias para limitar a disseminação e prevenir sobrecarga do sistema de saúde.

 

中文 - Mandarin

2020年5月8日

报告21-估算巴西的COVID-19病例数和再生
巴西是拉丁美洲COVID-19的流行重心。在本篇报告中,我们使用三种流行病学度量描述了巴西的流行:感染数,死亡数和再生数。我们的建模框架需要足够的死亡数据来估计趋势,因此,我们的分析仅限于累计死亡数超过50例的16个州。死亡数在这些州的分布非常不同,圣保罗,里约热内卢,塞阿拉州,伯南布哥州和亚马逊州这五个州占迄今报告死亡人数的81%。在这些州,我们估计受SARS-CoV-2感染人群的百分比范围为:从圣保罗的3.3%(95%置信区间:2.8%-3.7%)至亚马孙的10.6%(95%置信区间:8.8%- 12.1%)。流行开始时的再生数(传播强度度量)意味着一个受感染的人平均会再感染三、四个人。在非药物干预(例如关闭学校和人群移动下降)之后,我们显示了每个州的再生数均已大幅下降。但是,对于我们研究的16个州,我们具有高度信心再生数的估计仍保持在1以上。再生数大于1意味着该流行病尚未得到控制,并将继续增长。这些趋势与欧洲和亚洲其他主要的COVID-19流行形成鲜明对比,在欧洲和亚洲,强制性封城已成功地将传染数降至1以下。尽管巴西的流行在全国范围内仍处于早期阶段,但我们的结果表明需要采取进一步的行动以抑制传播并防止卫生系统不堪重负。

日本語 - Japanese

2020年5月8日

レポート21 - ブラジルにおける新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の症例数と再生産数の推定

ブラジルは、中南米におけるCOVID-19の震源地となっています。本レポートでは、感染数、死亡数、再生産数という3つの疫学的尺度を使用して、ブラジルでの流行について説明します。私たちのモデル化の枠組みでは、傾向を推定するために十分な死亡データが必要なため、合計50人以上の死者が発生した16州に分析を限定しています。各州の死者数の分布は非常に不均一で、これまでに報告された死者数の81%をサンパウロ、リオデジャネイロ、セアラ、ペルナンブーコ、アマゾナスの5州が占めています。これらの州で新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)に感染した人の割合は、サンパウロ州では3.3%(95%信頼区間:2.8%〜3.7%)、アマゾナス州では10.6%(95%信頼区間:8.8%〜12.1%)と推定されています。流行開始時の再生産数(感染強度の指標)は、1人の感染者から平均して3~4人に感染することを意味していました。学校閉鎖や人口移動の減少などの非医薬品介入を行った後、各州で再生産数が大幅に減少したことが示されています。しかし、私たちは調査した16州すべてについて、再生産数が1を超えたままであることを確信を持って推定しています。1を超える再生産数は、流行がまだ制御されておらず、拡大し続けていることを意味します。こうした傾向は、強制的な都市封鎖により再生産数が1を下回ったヨーロッパやアジアにおける他の大規模なCOVID-19の大流行とは全く対照的です。ブラジルでの流行はまだ全国規模では比較的初期段階にありますが、本研究の結果は、蔓延を抑え、医療崩壊を防ぐにはさらなる対策が必要であることを示しています。

Español - Spanish

Translation will be available shortly

Français - French

8 mai 2020

Rapport 21 - Estimation des cas de COVID-19 et du nombre de reproductions au Brésil

En Amérique latine, le Brésil est un épicentre de la COVID-19. Dans ce rapport, nous décrivons l’épidémie brésilienne à l’aide de trois mesures épidémiologiques : le nombre d’infections, le nombre de décès et le nombre de reproduction. Notre cadre de modélisation nécessite des données sur les décès en nombre suffisant pour estimer les tendances et nous limitons par conséquent notre analyse à 16 États, qui ont connu un total de plus de cinquante décès. La répartition des décès entre les États est particulièrement hétérogène, 5 États (São Paulo, Rio de Janeiro, Ceará, Pernambuco et Amazonas) représentant 81 % des décès signalés à ce jour. Dans ces États, nous estimons que le pourcentage de personnes contaminées par le SRAS-CoV-2 varie de 3,3 % (IC 95 % : 2,8 % - 3,7 %) à São Paulo à 10,6 % (IC 95 % : 8,8 % - 12,1 %) dans l’Amazonas. Le nombre de reproduction (une mesure de l’intensité de la transmission) au début de l’épidémie indiquait qu'un individu contaminé infecterait en moyenne trois ou quatre autres personnes. Suite aux interventions non médicamenteuses, telles que les fermetures des établissements scolaires et la diminution de la mobilité de la population, nous démontrons que le nombre de reproduction a considérablement baissé dans chaque État. Toutefois, pour les 16 États que nous étudions, nous sommes convaincus que le nombre de reproduction demeure supérieur à 1. Un nombre de reproduction supérieur à 1 signifie que l’épidémie n’est pas encore maîtrisée et continuera à de déployer. Ces tendances contrastent fortement avec d’autres foyers épidémiques majeurs de COVID-19 en Europe et en Asie, où les confinements ont permis de faire passer le nombre de reproduction en dessous de 1. Alors que l’épidémie brésilienne est encore relativement naissante, à l’échelle nationale, nos résultats suggèrent que des mesures supplémentaires sont nécessaires afin de limiter la propagation et de prévenir la surcharge du système de santé.

Italiano - Italian

8 Maggio 2020 – Imperial College London

Rapporto  21 – Stima del numero di casi di COVID-19 e del numero riproduttivo in Brasile
Il Brasile è un epicentro per COVID-19 nell’America Latina. In questo rapporto, descriviamo l’epidemia brasiliana utilizzando tre misure epidemiologiche: il numero di infezioni, il numero di decessi e il numero riproduttivo.  Il nostro modello richiede dati sui decessi sufficienti per stimare le tendenze, quindi limitiamo la nostra analisi a 16 stati che hanno subito un totale di oltre 50 morti. La distribuzione dei decessi tra gli stati è altamente eterogenea, con 5 stati – San Paolo, Rio de Janeiro, Ceará, Pernambuco e Amazonas – che rappresentano l’81% di tutti i decessi segnalati fino ad oggi. In questi stati, stimiamo che la percentuale di persone infettate con SARS-CoV-2 varia dal 3.3% (IC 95%: 2,8% -3,7%) a San Paolo, al 10.6% (IC 95%: 8.8%-12.1%) in Amazonas. Il numero riproduttivo (una misura dell’intensità di trasmissione) all’inizio dell’epidemia significava che un individuo infetto avrebbe infettato in media tre o quattro altre persone. A seguito di interventi non farmaceutici, come la chiusura delle scuole e la riduzione della mobilità della popolazione, mostriamo che il numero riproduttivo è diminuito sostanzialmente in ciascuno stato. Tuttavia, per tutti i 16 stati di questo studio, stimiamo con un’elevata confidenza che il numero riproduttivo sia rimasto al di sopra di 1. Un numero riproduttivo al di sopra di 1 significa che l’epidemia non sia ancora sotto controllo e continuerà a crescere. Questi trend sono in netto contrasto con altre grandi epidemie di COVID-19 in Europa e in Asia, dove lockdown forzati hanno portato con successo il numero riproduttivo al di sotto di 1. Mentre l’epidemia brasiliana è ancora relativamente recente su scala nazionale, i nostri risultati suggeriscono che sono necessarie ulteriori azioni per limitare la diffusione e prevenire il sovraccarico del sistema sanitario.

 

Arabic - العربية

08 مايو 2020- إمبريال كوليدج لندن

التقرير رقم 21 - تقدير حالات الإصابة بفيروس كورونا المستجد (كوفيد-19) ومعدل انتقال العدوى في البرازيل

تحولت البرازيل إلى بؤرة لجائحة فيروس كورونا المستجد (كوفيد-19) في أمريكا اللاتينية. وفي هذا التقرير نستعرض حالة الجائحة في البرازيل باستخدام ثلاثة مقاييس وبائية: عدد الإصابات وعدد الوفيات ورقم تكاثر الفيروس (معدل الإصابة). يتطلب إطار النمذجة لدينا وجود بيانات كافية عن الوفيات لتقدير الاتجاهات، وبالتالي فإننا نقصر تحليلنا على 16 ولاية شهدت إجمالي أكثر من خمسين حالة وفاة. ونشير هنا إلى أن توزيع الوفيات بين الولايات متباين للغاية، حيث تشكل 5 ولايات - ساو باولو وريو دي جانيرو وسيارا وبيرنامبوكو وأمازوناس - 81٪ من الوفيات المبلغ عنها حتى الآن.

 وفي هذه الولايات، نقدر أن النسبة المئوية للأشخاص الذين أصيبوا بفيروس كورونا المستجد تتراوح من 3.3٪ (نطاق الثقة 95٪: 2.8٪ -3.7٪) في ساو باولو إلى 10.6٪ (نطاق الثقة 95٪: 8.8٪ - 12.1٪) في أمازوناس. إن رقم التكاثر (مقياس لمعدل الانتقال) في بداية الوباء، يعني أن الفرد المصاب سيصيب ثلاثة أو أربعة آخرين في المتوسط.

 وبعد التدخلات غير الصيدلانية مثل إغلاق المدارس وتقييد حركة السكان، وجدنا أن رقم التكاثر قد انخفض بشكل كبير في كل ولاية. ومع ذلك، بالنسبة لجميع الولايات الـ 16 المشمولة في دراستنا، نقدر بثقة عالية أن رقم التكاثر لا يزال أعلى من 1. وبما أن رقم التكاثر أعلى من 1، فإن ذلك يعني أن الوباء لم تتم السيطرة عليه بعد وسيواصل التفشي.

 تتناقض هذه الاتجاهات تناقضًا صارخًا مع مسارات وباء فيروس كورونا الأخرى في أوروبا وآسيا، حيث أدت عمليات الإغلاق القسري إلى تخفيض رقم التكاثر إلى أقل من 1. وفي حين أن الوباء لا يزال في مراحله الأولى نسبيا في البرازيل، تشير نتائجنا إلى الحاجة إلى مزيد من الإجراءات للحد من تفشي الفيروس وتجنب زيادة الضغط على النظام الصحي.