Imperial College London

ProfessorJohnChambers

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Professor of Cardiovascular Medicine & Epidemiology
 
 
 
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172Medical SchoolSt Mary's Campus

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@article{Chen:2021:10.1038/s41588-021-00852-9,
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doi = {10.1038/s41588-021-00852-9},
journal = {Nature Genetics},
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RIS format (EndNote, RefMan)

TY  - JOUR
AB - Glycemic traits are used to diagnose and monitor type 2 diabetes and cardiometabolic health. To date, most genetic studies of glycemic traits have focused on individuals of European ancestry. Here we aggregated genome-wide association studies comprising up to 281,416 individuals without diabetes (30% non-European ancestry) for whom fasting glucose, 2-h glucose after an oral glucose challenge, glycated hemoglobin and fasting insulin data were available. Trans-ancestry and single-ancestry meta-analyses identified 242 loci (99 novel; P < 5 × 10−8), 80% of which had no significant evidence of between-ancestry heterogeneity. Analyses restricted to individuals of European ancestry with equivalent sample size would have led to 24 fewer new loci. Compared with single-ancestry analyses, equivalent-sized trans-ancestry fine-mapping reduced the number of estimated variants in 99% credible sets by a median of 37.5%. Genomic-feature, gene-expression and gene-set analyses revealed distinct biological signatures for each trait, highlighting different underlying biological pathways. Our results increase our understanding of diabetes pathophysiology by using trans-ancestry studies for improved power and resolution.
AU - Chen,J
AU - Spracklen,CN
AU - Marenne,G
AU - Varshney,A
AU - Corbin,LJ
AU - Luan,J
AU - Willems,SM
AU - Wu,Y
AU - Zhang,X
AU - Horikoshi,M
AU - Boutin,TS
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AU - Waage,J
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AU - Chan,KHK
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AU - Huerta-Chagoya,A
AU - Hwang,MY
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AU - Lai,S
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AU - Wang,C
AU - Wang,N
AU - Warren,HR
AU - Wen,W
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AU - Zhao,W
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AU - Lawlor,DA
AU - Lee,NR
AU - Lemaitre,RN
AU - Li,H
AU - Lin,S-Y
AU - Lindstrom,J
AU - Linneberg,A
AU - Liu,J
AU - Lorenzo
DO - 10.1038/s41588-021-00852-9
EP - 860
PY - 2021///
SN - 1061-4036
SP - 840
TI - The trans-ancestral genomic architecture of glycemic traits
T2 - Nature Genetics
UR - http://dx.doi.org/10.1038/s41588-021-00852-9
UR - http://gateway.webofknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcApp=PARTNER_APP&SrcAuth=LinksAMR&KeyUT=WOS:000656384400001&DestLinkType=FullRecord&DestApp=ALL_WOS&UsrCustomerID=1ba7043ffcc86c417c072aa74d649202
UR - https://www.nature.com/articles/s41588-021-00852-9
UR - http://hdl.handle.net/10044/1/98553
VL - 53
ER -